На сьогоднішній час територія Самбірсько-Дрогобицької єпархії охоплює 6 адміністративних районів Львівської області: Дрогобицький, Мостиський, Самбірський, Сколівський, Старосамбірський та Турківський, – на території яких проживає понад 400 тис. вірних УГКЦ. Задля зручності координування церковного життя єпархії її поділено на 20 деканатів, які налічують 220 парафій. Священиче служіння на теренах єпархії (станом на грудень 2010 р.) здійснюють 285 священиків.
У 1993 р. новоутворена Самбірсько-Дрогобицька єпархія успадкувала територіальні одиниці Львівської архиєпархії. Отож на той час територія єпархії була поділена на 6 деканатів, межі яких співпадали з кордонами адміністративних районів: Дрогобицький, Мостиський, Самбірський, Сколівський, Старосамбірський та Турківський.
Впродовж 1995 р. в єпархії проведено адміністративну реформу, плодом якої стало утворення 12 нових деканатів (Бориславський, Висоцький, Добромильський, Дрогобицький, Дрогобицький (районний), Меденицький, Мокрянський, Мостиський, Підбузький, Рудківський, Самбірський, Сколівський, Славський, Старосамбірський, Судововишнянський, Трускавецький, Турківський, Тухольківський) та встановлено нові межі для 6 існуючих. У 1999 р. створено Дублянський та Хирівський деканати, а в листопаді 2001 р. Дрогобицький (районний) деканат перейменовано на Лішнянський.
Відтак починаючи з 2001 р. до адміністративної структури єпархії належать 20 деканатів:
Бориславський, Висоцький, Добромильський, Дрогобицький, Дублянський, Лішнянський, Меденицький, Мокрянський, Мостиський, Підбузький, Рудківський, Самбірський, Сколівський, Славський, Старосамбірський, Судововишнянський, Трускавецький, Турківський, Тухольківський, Хирівський.
